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    流式細胞術(shù)實驗常見問題分析

    發(fā)布時間: 2024-04-22  點擊次數(shù): 494次

    流式細胞技術(shù)(Flow Cytometry,簡稱FCM)是一種高效的方法,用于分析和收集細胞懸液中的單個細胞。FCM的優(yōu)勢在于其速度快、結(jié)果客觀,并且具有重要的統(tǒng)計意義。它能夠處理復(fù)雜的樣本,同時收集多個參數(shù),其可靠性和重復(fù)性都非常出色。


    今天我將總結(jié)并分享一系列關(guān)于流式細胞技術(shù)的常見問題及其分析。對于流式細胞術(shù)的原理和步驟不甚清晰的同學(xué),建議先閱讀本公眾號以往的文章,了解背景知識。


    1.熒光抗體染色無信號或信號弱


    (1)加入的抗體量不足:這是普通的一種情況,只需要摸索實驗條件,適當(dāng)增加抗體的量或濃度。

    (2)細胞數(shù)量過多:熒光弱可能是因為細胞相對于染料太多了,應(yīng)該正確地調(diào)整細胞的密度,一般低于1*10^7/ml。

    (3)抗體儲存方式不對:抗體沒有保存在4℃并且避光,比如冷凍(-20℃甚至更低)保存可能會導(dǎo)致熒光抗體的沉降,顯著影響抗體染色效果。

    (4)用于細胞內(nèi)染色的熒光染料分子量太大:染料體積太大,因此其進入細胞的可能性降低。

    (5)一抗和二抗不相容:使用的二抗應(yīng)與一抗的物種來源相同(例如,一抗為兔源,則應(yīng)該使用抗兔源二抗)。

    (6)儀器問題:(流式細胞儀的光學(xué)系統(tǒng)由三個部分組成:激光器、濾光片和檢測器。激光器的數(shù)量、檢測器的數(shù)量以及濾光器的類型共同決定儀器的檢測范圍)。這三部分之一出現(xiàn)問題的時候,就無法檢測到熒光信號。

    濾光片選擇有誤:不同熒光有不同的發(fā)射譜,為了檢測到信號,需要搭配能夠捕捉到該波長信號的濾光片(濾光片可以將熒光激發(fā)后產(chǎn)生的相應(yīng)波長的光子引導(dǎo)至特定的傳感器上);激光器沒有對齊:必要時通過運行液流檢查微珠來調(diào)整路線。

    (7)靶蛋白不存在/表達水平低:巧婦難為無米之炊,要給靶蛋白染色,至少要確保組織/細胞類型表達的靶蛋白至少處于足夠檢測的量。

    (8)靶蛋白存在于細胞表面還是細胞內(nèi):有些抗原表達在細胞表面,有些表達在胞漿、細胞器內(nèi)、胞核,甚至有些在所有部位都表達。比如對細胞系進行染色時,胰蛋白酶通??梢砸鸺毎砻娴鞍椎膬?nèi)化,因此需要確定好抗原的表達位置,選擇合適的染色方法。

    (9)靶蛋白的表達需要經(jīng)過誘導(dǎo):有些抗原在活化后發(fā)生下調(diào),而有些蛋白則需要被誘導(dǎo)才能表達。因此要選擇合適的方法激活細胞,使其充分表達靶蛋白,同時要加蛋白轉(zhuǎn)運抑制劑使其留在胞內(nèi),然后固定破膜,染相應(yīng)抗體。

    (10)靶蛋白是分泌蛋白分泌蛋白的檢測十分困難,因為蛋白會在檢測前從細胞中釋放出來且可能快速降解。高爾基體阻斷劑(如布雷非德菌素A)可用于抑制表達蛋白的分泌,使其仍保留在高爾基體中。然后再用細胞內(nèi)染色法檢測靶標(biāo)蛋白。

    (11)補償過高:使用陽性對照再次正確設(shè)置流式細胞儀

    2.熒光強度過高

    (1)抗體濃度過高:這將會導(dǎo)致非常明顯的非特異性結(jié)合或者是特異性結(jié)合的高強度熒光。

    (2)過多抗體被捕獲于細胞內(nèi):在胞內(nèi)染色的時候,較大的熒光分子被困在細胞內(nèi)部。

    (3)封閉不足:封閉這個操作可以有效地減少染料和蛋白的非特異性結(jié)合。

    3.在應(yīng)該只有一個細胞群的情況下觀察到多個細胞群

    (1)樣品本身含有多個表達靶蛋白的細胞群:有可能是因為表達該靶蛋白的細胞群不止一個,但操作過程中沒有做好分離。

    (2)出現(xiàn)細胞雙峰:出現(xiàn)了第一群兩倍熒光強度的第二群細胞??赡苁羌毎蛛x不充分甚至是細胞團塊沒有過濾掉,導(dǎo)致檢測時多個細胞聚集在一起。

    4.儀器檢測到的粒子太少

    (這里的粒子指的是上樣時儀器檢測到的微粒,有可能是細胞,也有可能是破碎細胞產(chǎn)生的細胞器,或者沒有充分分離而形成的細胞團塊)

    (1)細胞密度低:即每毫升樣品的細胞數(shù)目太少,自然檢測的效率就不高。

    (2)檢測的參數(shù)當(dāng)中電壓設(shè)置得太低。

    (3)細胞聚集,堵塞管道:多個細胞聚集成團快,卻被檢測成一個粒子,且該粒子大小是異常的,在后續(xù)圈門也有可能被廢棄。染色前要輕輕吹打幾次,確保形成單細胞懸液,上樣之前最好再次混勻。另外,染細胞死活對于這一問題也有幫助,因為死細胞會釋放它的DNA,而DNA非常粘稠,最后會導(dǎo)致細胞成團。

    5.背景高或陽性細胞百分比高

    (1)抗體過量。

    (2)補償過低:流式細胞分析中經(jīng)常要用到2種以上的熒光標(biāo)記抗體進行染色,而目前所使用的多種熒光染料發(fā)射譜間有一定重疊,也就是說,熒光A的激發(fā)光會有一部分被熒光B的通道檢測到,這就是熒光溢漏。例如,當(dāng)我們在進行單色流式實驗的時候,可以在其他通道砍到熒光信號,這些熒光信號就是溢漏出來的熒光,而糾正熒光溢漏的過程就是“補償"。補償太低,就無法正確地糾正這些溢漏的熒光信號,使背景變高。

    6.側(cè)向散射(反映細胞的顆粒度)背景高

    (1)細胞裂解過度:制備樣品時離心或振蕩過度,使細胞破碎產(chǎn)生細胞碎片。

    (2)細菌污染:從其它微小顆粒和背景信號中區(qū)分細菌群落的方法是用熒光染料標(biāo)記細菌,然后使用該熒光來識別目標(biāo)群落。

    (3)死細胞的處理:流式細胞術(shù)非常容易被死細胞干擾,因為死細胞比活細胞更容易攝取抗體和探針,導(dǎo)致明顯的非特異性染色。且死細胞的自發(fā)熒光往往特別強,這樣背景熒光變強,就無法觀察到一些靶蛋白的弱陽性表達了。

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